爱丽丝（邦尼·亨特 饰）和乔治（查尔斯·格罗丁 饰）带着三个孩子瑞斯（尼科尔·汤姆 饰）、泰德（克里斯托弗·卡斯提尔 饰）和艾米丽（萨拉·罗斯·卡尔 饰）住在城郊的一所大房子里，过着平静幸福的生活，直到有一天，一只可怜可爱的流浪狗出现在牛顿家门口。在三个孩子的苦苦哀求下，小狗成为了牛顿家的新成员，并被取名为贝多芬。 随着时间的推移，长大的不只是牛顿三个孩子，贝多芬也长大了。短短几个月的时间，原本娇小可爱的贝多芬已化身为庞然大物，不断惹是生非。与此同时，贝多芬也给牛顿一家带来了深深的快乐。贝多芬的存在引起了兽医瓦尼克（迪恩·琼斯 饰）的注意，邪恶的医生开始想尽一切办法试图将贝多芬夺走作为自己的宠物 自己的。

1824年，维也纳。年仅23岁的安娜·霍德斯（黛安·克鲁格饰）凭借自己对音乐的出色理解，成为贝多芬（艾德·哈里斯饰）的乐谱抄写员。贝多芬一心想创作自己的“告别作品”。安娜原本想借为贝多芬工作的机会，向他学习，成为一名出色的作曲家，但很快她就发现贝多芬是一个固执、粗鲁、疯狂、沉浸在自己世界中的人。贝多芬的《第九交响曲》首演因安娜危难之际的帮助而获得成功，两人的关系逐渐好转。当安娜拿出自己写给贝多芬的乐谱来评价时，引起了贝多芬的尖刻嘲讽，安娜愤然离去。在贝多芬的要求下，安娜回到贝多芬身边，试图接受他偏激的言辞所传达的意见。安娜似乎渐渐理解了这位天才大师…… 2007年，该片获有“西班牙奥斯卡”之称的戈雅奖最佳欧洲电影提名。

故事顺着上一集的发展，小狗贝多芬和露西终于走到了一起，过上了幸福的生活，露西也为贝多芬生下了四只可爱的小狗，一家人其乐融融。然而这四只小狗却给孩子们带来了困扰，要是他们的父亲知道这四个小家伙突然出现在这个家庭中，那可就惨了。 虽然被父亲训斥了一顿，但善良的布鲁诺先生（凯文·邓恩 饰）还是收留了贝多芬和露西的孩子，一家人前往安静的村庄开始了悠闲的度假。然而他们不知道的是，布鲁诺的前妻雷吉娜（黛比·玛扎 饰）早已盯上了小狗，她要偷它们卖掉赚一笔。得知此事的贝多芬身先士卒，带着妻儿躲进了深山，雷吉娜紧随其后。